158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1319 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 165 aa  333  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  42.67 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  30.85 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  53.97 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42.39 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  36.97 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  31.95 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  53.57 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  45.07 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  31.95 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  28.73 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  28.99 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  44.74 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  44.83 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  44.83 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 86 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 64 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  29.09 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  44 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  41.38 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  54.76 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  52.08 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  36 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  28.68 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  42.86 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.66 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.24 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  30 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 398 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  26.23 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.71 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 466 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  41.07 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.57 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  41.07 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  41.07 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  28.67 
 
 		 578 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  36.47 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  34.92 
 
 		 119 aa  52  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 58 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  37.08 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  41.07 
 
 		 445 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  35.24 
 
 		 346 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  29.35 
 
 		 97 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 81 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  31.63 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 65 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  51.67 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  44.44 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 400 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  36.67 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  38.33 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 128 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 128 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  38.6 
 
 		 419 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  32.09 
 
 		 129 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 		 87 aa  48.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>