172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2843 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 68 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  57.81 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  63.33 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  52.46 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  55.74 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  52.46 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  53.97 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  55 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  55 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  55 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  55 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  55 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  46.03 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  55 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  46.03 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  51.67 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  50.79 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  54.39 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  51.67 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  58.62 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  55.93 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  51.67 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  51.67 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  49.15 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 416 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  45.61 
 
 		 515 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  48.39 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  69.23 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  39.68 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  50.82 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  47.92 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  56.45 
 
 		 233 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 62 aa  57  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  43.1 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  40.62 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  40.98 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  48.44 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 847 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40.35 
 
 		 419 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  69.44 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  62.16 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 578 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  43.64 
 
 		 445 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 170 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  40.35 
 
 		 555 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  40.62 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 474 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.45 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  34.92 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2452  phage shock protein C, PspC  51.06 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000523744  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 394 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  39.34 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  48.21 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  56.52 
 
 		 464 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  36.92 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  52.17 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  47.92 
 
 		 847 aa  48.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  38.81 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 190 aa  48.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  37.93 
 
 		 582 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  37.88 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  37.88 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  37.88 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  37.88 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>