81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1724 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  73.91 
 
 		 119 aa  173  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  64.66 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  63.25 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  62.39 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  62.39 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  62.39 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  59.83 
 
 		 119 aa  147  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.26 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  58.26 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.26 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.26 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.26 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.26 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.26 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  58.26 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  60 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  58.26 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  55.65 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  55.65 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  55.65 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  55.65 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  55.65 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  37.21 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  33.33 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  32.56 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  34.17 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  34.17 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  34.17 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  34.17 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  34.17 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  32.52 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  32.5 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  30.16 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  31.71 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  30.71 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  31.67 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  31.67 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  30.33 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  30.83 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  31.3 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  27.7 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  29.73 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  44.12 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  31.3 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  35.24 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  32.52 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  53.19 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  37.66 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  37.66 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  28.18 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  50 
 
 		 515 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  51.02 
 
 		 416 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  45.28 
 
 		 70 aa  43.9  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  38.57 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  26.36 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  47.73 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 418 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  34.72 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  33.77 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  26.23 
 
 		 140 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  46.77 
 
 		 64 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  31.96 
 
 		 847 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  48.15 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4752  phage shock domain-containing protein  43.48 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  41.51 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 578 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  28.81 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  38.24 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  39.39 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  27.93 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 346 aa  40  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 59 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>