74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3790 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
108 aa  214  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  81.91 
 
 
110 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  79.79 
 
 
110 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  79.79 
 
 
110 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  41.76 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  50.85 
 
 
394 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  52.73 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  50.85 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  48.15 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  42.47 
 
 
82 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  54.17 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 
847 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  56.36 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5559  phage shock protein C, PspC  52.73 
 
 
371 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  49.09 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
458 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  33.78 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 
419 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 
578 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  42.86 
 
 
244 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
427 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  45.28 
 
 
445 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  43.94 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  48.98 
 
 
497 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  48.21 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  42.86 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  38.89 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 
416 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
481 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  34.29 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  48.08 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  35.44 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  27.96 
 
 
419 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  32.88 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  32.31 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  37.68 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  36.07 
 
 
515 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  42.25 
 
 
119 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 
82 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 
174 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  39.02 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  41.54 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
484 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 
256 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 
512 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  37.88 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.25 
 
 
248 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  41.51 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  24.75 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
61 aa  40  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
477 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  45 
 
 
67 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
423 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 
127 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
400 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>