77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2167 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  100 
 
 
119 aa  242  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  79.83 
 
 
119 aa  202  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  79.83 
 
 
119 aa  202  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  79.83 
 
 
119 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  79.83 
 
 
119 aa  202  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  79.83 
 
 
119 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  79.83 
 
 
119 aa  202  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  80.67 
 
 
119 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  80.67 
 
 
119 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  79.83 
 
 
119 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  80.67 
 
 
119 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  80.67 
 
 
119 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  80.67 
 
 
119 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  78.99 
 
 
119 aa  199  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  78.99 
 
 
119 aa  199  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.82 
 
 
119 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.82 
 
 
119 aa  154  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.82 
 
 
119 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  63.48 
 
 
121 aa  150  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  62.61 
 
 
121 aa  149  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  58.41 
 
 
119 aa  148  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  60 
 
 
117 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  56.52 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  34.65 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  30.47 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  34.92 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  30.23 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  30.47 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  31.75 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  31.97 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  31.97 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  29.37 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  33.06 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  32.56 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  32.56 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  32.56 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  32.56 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  32.56 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  35.94 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  31.75 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  34.33 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  27.89 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  36.25 
 
 
150 aa  58.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  53.7 
 
 
515 aa  54.7  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  37.08 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  31.75 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  29.09 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  34.92 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  29.73 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
578 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  36.92 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  26.79 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  30.65 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  42.11 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  30.65 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 
86 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  37.93 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  30.19 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  41.33 
 
 
207 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 
233 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  32.47 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  27.63 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  35.38 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  27.03 
 
 
193 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  39.29 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  39.29 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  39.29 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  39.29 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>