59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1801 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  64 
 
 		 140 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  58.82 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  53.04 
 
 		 147 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  33.87 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  34.96 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  34.96 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  33.06 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  31.67 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  29.31 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  30.89 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  31.97 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  29.92 
 
 		 128 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  32.26 
 
 		 131 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  29.23 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  29.23 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  29.23 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  29.23 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  29.23 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  31.08 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  29.92 
 
 		 128 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  29.92 
 
 		 128 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  29.13 
 
 		 128 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  26.09 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.91 
 
 		 121 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  28.46 
 
 		 131 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  28.17 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  23.65 
 
 		 148 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.06 
 
 		 121 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.41 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.41 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.41 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 394 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 83 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.93 
 
 		 119 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  27.93 
 
 		 119 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.93 
 
 		 119 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.93 
 
 		 119 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.93 
 
 		 119 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.93 
 
 		 119 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.93 
 
 		 119 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  27.93 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  27.93 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.82 
 
 		 119 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 		 74 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  32.41 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.73 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.73 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.73 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.73 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.73 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 64 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 95 aa  42  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 92 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 77 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  32.31 
 
 		 82 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>