More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4227 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 394 aa  779    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  57.96 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  59.84 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  57.18 
 
 		 394 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  53.35 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  47.07 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  47.98 
 
 		 444 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  41.39 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 423 aa  272  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  47.37 
 
 		 441 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 466 aa  259  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 418 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.83 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  41.01 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 480 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 477 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.18 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 564 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  50 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 546 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 1168 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 742 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  49.28 
 
 		 110 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  49.28 
 
 		 110 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  49.28 
 
 		 110 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.4 
 
 		 731 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 780 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  29.87 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  32.06 
 
 		 1033 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.65 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  30.29 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  27.6 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 782 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 1229 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  34.87 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  42.86 
 
 		 178 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  27.55 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  30.1 
 
 		 666 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 97 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  50.85 
 
 		 108 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  26.67 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5559  phage shock protein C, PspC  52 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  50.7 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 86 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  25.24 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  25.99 
 
 		 1048 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  39.06 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  26.37 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  25.37 
 
 		 772 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 1226 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  24.27 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  30.1 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  24.21 
 
 		 954 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  29.61 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  27.69 
 
 		 523 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 655 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 640 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 127 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  27.64 
 
 		 795 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 523 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  25.58 
 
 		 585 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 177 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>