70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01874 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  269  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  89.92 
 
 		 129 aa  249  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  65.89 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  53.12 
 
 		 128 aa  153  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  44.44 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  38.51 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  41.27 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  40.48 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  40.48 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  40.48 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  40.48 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  40.48 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  40.48 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  40.48 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  41.38 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  42.06 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  42.06 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  35.86 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  40.31 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.71 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.22 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.71 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  32.31 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  32.31 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.31 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.31 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.31 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.31 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  32.31 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.31 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.31 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.92 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.92 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.92 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.25 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.25 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.25 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.25 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.25 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  32.56 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.47 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  30 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  28.35 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  31.45 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  32.54 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  34.4 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  30.47 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  31.01 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  29.37 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  41.27 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  36.07 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  28.57 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  36.07 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  45.24 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  31.82 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  26.5 
 
 		 578 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 77 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 416 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 449 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  29.73 
 
 		 79 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>