113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2555 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  58.73 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  54.1 
 
 
233 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  54.1 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  50.79 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  48.44 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  45.31 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  45.31 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  50.82 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  60 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  45.16 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  55 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  53.85 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  44.83 
 
 
240 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  50.88 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  44.83 
 
 
70 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 
127 aa  52  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 
152 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  62.5 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  37.93 
 
 
244 aa  50.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  50.82 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  39.39 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  48.39 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 
177 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  48.39 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 
847 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  51.67 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  49.15 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  36.07 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  32.76 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  40.98 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  35.94 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  46 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  42.37 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  37.1 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2212  phage shock protein C, PspC  55.56 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 
103 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.71 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  39.34 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2057  phage shock protein C, PspC  60 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.855415  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  35.38 
 
 
578 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  39.34 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
398 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 
256 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 
306 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  37.7 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  37.7 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  51.22 
 
 
464 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  33.33 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
394 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 
184 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  35.59 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
481 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  44.44 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  31.82 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
400 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
400 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  37.88 
 
 
346 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 
107 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2164  hypothetical protein  45.31 
 
 
154 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.771382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 
847 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  40.68 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>