102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3932 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  88.54 
 
 		 96 aa  174  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  40.86 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  41.89 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  36.92 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  43.33 
 
 		 240 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  41.38 
 
 		 419 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  41.27 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 394 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  34.92 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  44.44 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  32.93 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  40.85 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 458 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  44.12 
 
 		 306 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  33.72 
 
 		 847 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 400 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  45.61 
 
 		 555 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 394 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  43.86 
 
 		 445 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 416 aa  48.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 533 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 398 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 474 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 547 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.32 
 
 		 418 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  36.21 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  28.89 
 
 		 511 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  32.22 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 512 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  37.5 
 
 		 445 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  34.29 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  27.59 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  34.29 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  35.71 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 419 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 464 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.93 
 
 		 427 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  37.33 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2452  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000523744  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 418 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 404 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  33.87 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  36.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  40.58 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 484 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 481 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 346 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 578 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  35.94 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  23.47 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  34.09 
 
 		 847 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 466 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 114 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.4 
 
 		 248 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 68 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 399 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  31.88 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 449 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  43.18 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  33.9 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  30.14 
 
 		 601 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 452 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.21 
 
 		 404 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 455 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>