32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0436 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 452 aa  917    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  27.38 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  28.72 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  29.11 
 
 		 601 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  28.34 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  28.74 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  27.93 
 
 		 847 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  28.18 
 
 		 847 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  29.15 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  35.62 
 
 		 77 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  34.25 
 
 		 244 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  37.21 
 
 		 143 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  34.25 
 
 		 70 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 95 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  32.32 
 
 		 164 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  35.29 
 
 		 82 aa  47.4  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  28.33 
 
 		 170 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 87 aa  47  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 138 aa  46.6  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 152 aa  46.6  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  38.57 
 
 		 169 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  34.18 
 
 		 190 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 		 96 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  40.62 
 
 		 131 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 131 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 165 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  30.61 
 
 		 174 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  35.8 
 
 		 81 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  35.71 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  27.52 
 
 		 131 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>