16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0055 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  719    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  27.73 
 
 		 578 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  27.62 
 
 		 515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  26.46 
 
 		 582 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  29.6 
 
 		 452 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  23.9 
 
 		 601 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  27.8 
 
 		 847 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  23.04 
 
 		 847 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  24.1 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  39.71 
 
 		 76 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  32.84 
 
 		 108 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  38.36 
 
 		 126 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 82 aa  46.2  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  34.85 
 
 		 150 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 62 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.67 
 
 		 119 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>