63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0209 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 126 aa  261  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  61.42 
 
 		 126 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  51.59 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  34.59 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  33.83 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  35.71 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  30.47 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  50.82 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  31.75 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  34.38 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  34.38 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  34.38 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  34.38 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  34.38 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  31.43 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  32.69 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  32.81 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  27.27 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  30.53 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  28.16 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  33.59 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  26.98 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.18 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  30.1 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 578 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  26.32 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  38.36 
 
 		 351 aa  47  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.48 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  23.68 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  28.57 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.36 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.36 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  29.36 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.36 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.36 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.36 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.66 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.66 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.66 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  29.36 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  25.23 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  44.23 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  29.36 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  27 
 
 		 515 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  29.36 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 394 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.59 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.59 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.59 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.59 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  27.59 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 66 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  39.62 
 
 		 582 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  25.96 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.19 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1049  phage shock protein C, PspC  73.33 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>