125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0468 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  100 
 
 		 515 aa  1061    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  29.19 
 
 		 601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  27.86 
 
 		 582 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  26.38 
 
 		 578 aa  160  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  28.4 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  38.79 
 
 		 847 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  30.58 
 
 		 847 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  28.12 
 
 		 351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  31.66 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  43.66 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 		 138 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 		 95 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  43.33 
 
 		 82 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 68 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 		 107 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  47.37 
 
 		 79 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  44.78 
 
 		 70 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 71 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  40.54 
 
 		 108 aa  57  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 165 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  45.76 
 
 		 61 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 66 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 152 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  53.7 
 
 		 119 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 143 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  49.12 
 
 		 119 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  49.12 
 
 		 119 aa  54.3  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  49.12 
 
 		 119 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 127 aa  54.3  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  41.38 
 
 		 70 aa  53.5  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.47 
 
 		 248 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  45 
 
 		 119 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  40.35 
 
 		 127 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 174 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 177 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.85 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  29 
 
 		 124 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 98 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 481 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 92 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  45 
 
 		 121 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.91 
 
 		 119 aa  50.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  45 
 
 		 121 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 169 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  36.21 
 
 		 61 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 		 61 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 170 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 86 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 190 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.97 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 67 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 		 77 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  42.59 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  30.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 81 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 61 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.36 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  42.59 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  35.42 
 
 		 207 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  43.14 
 
 		 136 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 86 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.3 
 
 		 119 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.3 
 
 		 119 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.3 
 
 		 119 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.3 
 
 		 119 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.3 
 
 		 119 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 85 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  50 
 
 		 117 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 59 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 164 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 477 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 87 aa  47.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 149 aa  47.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 		 124 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 64 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 61 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 103 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  32.88 
 
 		 86 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  31.11 
 
 		 114 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 64 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 81 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  32.79 
 
 		 178 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  31.03 
 
 		 61 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  31.03 
 
 		 61 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>