93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0060 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 108 aa  214  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  55.36 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  51.79 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  42.65 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  35.16 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  36.36 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.94 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  42.59 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.85 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  41.82 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  38.33 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28830  putative stress-responsive transcriptional regulator  53.7 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  30.68 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  48.08 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  36 
 
 		 511 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 394 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  39.66 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  39.66 
 
 		 244 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  32.84 
 
 		 351 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.94 
 
 		 256 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  32.86 
 
 		 847 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  36.51 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  44.23 
 
 		 445 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5559  phage shock protein C, PspC  36.62 
 
 		 371 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  39.34 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 552 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  37.25 
 
 		 416 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  43.14 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  36.92 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 233 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  38.18 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1310  phage shock protein C, PspC  54.17 
 
 		 49 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000931741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  35.94 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  45.1 
 
 		 346 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  31.03 
 
 		 71 aa  43.5  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.18 
 
 		 427 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  37.5 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  47.37 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  42.59 
 
 		 445 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  32.22 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  31.25 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  33.9 
 
 		 79 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  35.82 
 
 		 114 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  30.48 
 
 		 847 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 466 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  33.33 
 
 		 582 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  32.31 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  33.9 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  36.73 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>