165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0542 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  45.26 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  51.43 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  49.35 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  36.71 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  35.35 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  50.75 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 		 394 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  45.12 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  45.12 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  43.9 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  44.93 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  36.14 
 
 		 511 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  38.3 
 
 		 555 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  38.03 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  35 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  38.6 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 399 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  32.43 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  34 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  32.18 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 484 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 481 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  44.9 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  31.13 
 
 		 582 aa  54.3  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  38.04 
 
 		 419 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  39.02 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 346 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  54.9 
 
 		 436 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 847 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  30.95 
 
 		 578 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  47.76 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.79 
 
 		 533 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  31.03 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  49.18 
 
 		 256 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  29.03 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  42.67 
 
 		 497 aa  50.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  50 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 449 aa  50.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  33.73 
 
 		 469 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5559  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 371 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  31.67 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  36.23 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  39.62 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 416 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  33.68 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  31.67 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 458 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  34.33 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 418 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  36 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  33.87 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 427 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  32.88 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 477 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  28.33 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  28.33 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  31.65 
 
 		 417 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>