93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0132 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 82 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0967  PspC domain-containing protein  61.43 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0365366  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  53.73 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  58.62 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  43.75 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  50.91 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  44.29 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  46.88 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.77 
 
 		 427 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  38.33 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  38.33 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  40.3 
 
 		 445 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 511 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 400 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  34.55 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.82 
 
 		 256 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 394 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 512 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 578 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  31.67 
 
 		 244 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  46.77 
 
 		 533 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 497 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  36.07 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  41.54 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 547 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  41.51 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  51.92 
 
 		 417 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 394 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 464 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  39.39 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 194 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.75 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.68 
 
 		 418 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  32.31 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 399 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 847 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 552 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  32.73 
 
 		 582 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  45.83 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  35.94 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 110 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  28 
 
 		 149 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 108 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  37.68 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 67 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 110 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28830  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 57 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217612 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  38.24 
 
 		 346 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 110 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  30 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  36.62 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 416 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  41.86 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 466 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  40.74 
 
 		 445 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.34 
 
 		 248 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  40.35 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  31.52 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  39.58 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 481 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  34.67 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  42.37 
 
 		 419 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 131 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 128 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>