82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0967 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0967  PspC domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0365366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  61.43 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  50.75 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  49.12 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  47.17 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  43.28 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  43.84 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  38.98 
 
 		 244 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.25 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  44.07 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  43.08 
 
 		 445 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  43.08 
 
 		 511 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  34.38 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 464 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  43.86 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 533 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  36.11 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  37.7 
 
 		 582 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  36.99 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  32.18 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  47.17 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  36.36 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  37.21 
 
 		 552 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  34.18 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  43.08 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 399 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 547 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 394 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  42.11 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  36.92 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  31.17 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 418 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  30 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 847 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.37 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  26.83 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 127 aa  42  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  40 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  34.92 
 
 		 70 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  30.36 
 
 		 149 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 474 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  36.92 
 
 		 68 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 67 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 110 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 458 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  28.79 
 
 		 578 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  38.16 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  32.73 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  32.93 
 
 		 847 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 497 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  37.04 
 
 		 445 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 480 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 65 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>