84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0585 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
77 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  53.73 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  51.85 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0967  PspC domain-containing protein  49.28 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0365366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  53.45 
 
 
427 aa  57.4  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  55.36 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
59 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  42.19 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  42.59 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  42.19 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  43.1 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  38.1 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 
533 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  40.35 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
484 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 
464 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  44.68 
 
 
547 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  33.82 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  48.94 
 
 
491 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 
847 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
394 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  39.29 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 
512 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  37.88 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  37.7 
 
 
445 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 
84 aa  43.9  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  43.14 
 
 
417 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  38.98 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 
511 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
449 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  31.94 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  31.25 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  34.69 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 
552 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  35.38 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  36.54 
 
 
445 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.32 
 
 
256 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  35.59 
 
 
81 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 
149 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 
143 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  33.33 
 
 
244 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
394 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.43 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.19 
 
 
418 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
468 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 
416 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>