171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1233 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  43.98 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  34.21 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  30.11 
 
 		 244 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  57.81 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  43.56 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  32.24 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  38.24 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  32.45 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  32.58 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  31.29 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  46.67 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  46.67 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  53.33 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38.96 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  53.45 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  33.08 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  51.72 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  51.72 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  51.72 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  51.72 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  51.72 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  48.28 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  48.28 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  40.26 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  43.75 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  31.96 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  30.36 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  28.66 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  40.98 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  29.51 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  48.15 
 
 		 416 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  32.41 
 
 		 847 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  33.33 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  41.94 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  32.63 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  43.64 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  46.55 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.35 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  58.7 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  51.06 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  29.9 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  25.9 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  31.07 
 
 		 346 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  31.96 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  31.96 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  40.32 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  37.88 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 578 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  28.23 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  30.19 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  37.29 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  30.93 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  31.97 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  31.11 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 497 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  26.04 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 552 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  29.87 
 
 		 103 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  36.92 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  42.86 
 
 		 582 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  33.87 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  36.36 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  29.17 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.96 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.33 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  32.73 
 
 		 445 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>