88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4439 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 306 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.64 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  33.97 
 
 		 555 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  38.32 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1049  phage shock protein C, PspC  68.18 
 
 		 105 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  54.55 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 85 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  48.53 
 
 		 97 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 		 174 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  44.83 
 
 		 95 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  44.83 
 
 		 82 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 		 177 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 86 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  31.03 
 
 		 170 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.98 
 
 		 427 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  44.93 
 
 		 96 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  34.74 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 458 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 481 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  30.83 
 
 		 474 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  25.68 
 
 		 464 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 127 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 		 65 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  26.32 
 
 		 445 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.49 
 
 		 533 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 84 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  36.49 
 
 		 81 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 466 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 71 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 184 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 419 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.1 
 
 		 86 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.62 
 
 		 87 aa  49.7  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 114 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  27.96 
 
 		 578 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  37.5 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  51.72 
 
 		 66 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  26.53 
 
 		 464 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  44.12 
 
 		 96 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  41.07 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  31.31 
 
 		 468 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  48.15 
 
 		 92 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0761  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.269654  normal  0.633867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 398 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  44.29 
 
 		 76 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  44.64 
 
 		 70 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 		 143 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 77 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  27.82 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  32.77 
 
 		 416 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 		 66 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  44.07 
 
 		 129 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  47.17 
 
 		 59 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 		 67 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 67 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  52.63 
 
 		 61 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  35.94 
 
 		 582 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  38.16 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 		 61 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  33.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 165 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  23.03 
 
 		 515 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  26.13 
 
 		 547 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 477 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 67 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0345  hypothetical protein  31.03 
 
 		 417 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 484 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 107 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 62 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  29.73 
 
 		 147 aa  43.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  42.59 
 
 		 178 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  29.07 
 
 		 417 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 103 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  37.5 
 
 		 70 aa  42.7  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 61 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 64 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 847 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 110 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>