97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3608 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  100 
 
 		 419 aa  820    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  28.36 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  31.59 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  29.44 
 
 		 445 aa  86.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.23 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  48.39 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  29.87 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  47.83 
 
 		 92 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  27.45 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  34.34 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  49.15 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  22.75 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  38.89 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  44.83 
 
 		 86 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  36.61 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 		 95 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  41.89 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  28.26 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  47.76 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 103 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  40.16 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 86 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  50.85 
 
 		 84 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  43.18 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  45.45 
 
 		 240 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  32.74 
 
 		 512 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  29.03 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  28.81 
 
 		 555 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.33 
 
 		 533 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 152 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  41.59 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 194 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 68 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 114 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 		 190 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 177 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 127 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 96 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 66 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 138 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 107 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  28.42 
 
 		 119 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 58 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 85 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  29.23 
 
 		 552 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 61 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  35 
 
 		 61 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 96 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  38.18 
 
 		 61 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  38.18 
 
 		 61 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  38.18 
 
 		 61 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  38.18 
 
 		 61 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  38.18 
 
 		 61 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  38.18 
 
 		 61 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  38.18 
 
 		 61 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 161 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 61 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 127 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 143 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 165 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  33.09 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  38.75 
 
 		 98 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  35.09 
 
 		 129 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  36.23 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  51.22 
 
 		 111 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 61 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 67 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  57.81 
 
 		 136 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 74 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  32.95 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  33.78 
 
 		 81 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 65 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  30.21 
 
 		 110 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  30.21 
 
 		 110 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  30.21 
 
 		 110 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 85 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  36.67 
 
 		 582 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 67 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  32.76 
 
 		 515 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 394 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.72 
 
 		 354 aa  43.5  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  27.96 
 
 		 108 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>