50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1227 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1087    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  41.83 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  47.45 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  29.31 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  32.35 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.47 
 
 		 86 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  25 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  26.95 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  27.63 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  47.62 
 
 		 97 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  30.45 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  41.82 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  43.64 
 
 		 127 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  35.62 
 
 		 161 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0913  phage shock protein C, PspC  26.09 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 71 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  39.36 
 
 		 119 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 92 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 68 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  38.95 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  40.28 
 
 		 103 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 98 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 		 398 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 96 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  39.77 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 96 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 		 127 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  41.33 
 
 		 124 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  34.72 
 
 		 86 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  25.09 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  39.39 
 
 		 533 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 177 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  29.91 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  44.64 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 194 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 81 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  33.96 
 
 		 174 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 85 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 61 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  32.1 
 
 		 84 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  33.09 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  48.89 
 
 		 147 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5724  phage shock protein C, PspC  34.78 
 
 		 383 aa  43.9  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1049  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 105 aa  43.9  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>