More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 481 aa  946    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  64.81 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  52.22 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 394 aa  329  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 466 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  46.08 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  43.99 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  42.7 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  43.81 
 
 		 394 aa  236  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.72 
 
 		 404 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 364 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.35 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  48.96 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 333 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.77 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 383 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 545 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  30.46 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 546 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.22 
 
 		 1033 aa  73.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 1168 aa  71.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.18 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 682 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  29.58 
 
 		 646 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 700 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 372 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 1229 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  32.89 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 1101 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  31.88 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  27.5 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 851 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  29.13 
 
 		 397 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 352 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 742 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 638 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  25.09 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  25.83 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 1226 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  27.31 
 
 		 1031 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.09 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  25.94 
 
 		 772 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  28.73 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  29.69 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  29.69 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.69 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.69 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  29.69 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.69 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  30.99 
 
 		 598 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.69 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.69 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  31.98 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.27 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  25.82 
 
 		 395 aa  62  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.27 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.27 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.46 
 
 		 772 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.27 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>