More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1879 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 368 aa  695    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.95 
 
 		 731 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 745 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 767 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 396 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 851 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 739 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  54.65 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  36.29 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 894 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  54.65 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 780 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  44.94 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  45.35 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  42.11 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.78 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3277  histidine kinase  41.41 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389696  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  48.05 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 771 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.78 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  38.84 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 801 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  39.34 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.45 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3762  histidine kinase  37.5 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.026612 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  38.53 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  30.71 
 
 		 967 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  28.25 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  34.69 
 
 		 666 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  26.71 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  39.08 
 
 		 1809 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  30.19 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  36.04 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  31.41 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 586 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  39.36 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  38.78 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  38.3 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  29.43 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  44.57 
 
 		 686 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.3 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  31.28 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 782 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 692 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  30.09 
 
 		 772 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0181  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.36 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 1229 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 709 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  39.78 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  43.33 
 
 		 594 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 801 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 775 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 1226 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  31.75 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 680 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>