167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3447 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 894 aa  1704    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 851 aa  292  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 780 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 396 aa  92.4  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 739 aa  77  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 782 aa  76.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 383 aa  70.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  45.98 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.07 
 
 		 731 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.58 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  33.49 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  40.43 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  32.8 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  36.79 
 
 		 440 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  26.69 
 
 		 427 aa  60.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  31.98 
 
 		 666 aa  59.3  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  34.38 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  30.43 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  31.28 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 501 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 767 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3152  putative signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 396 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  0.708256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  26.94 
 
 		 683 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 745 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 404 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 440 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 615 aa  55.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 419 aa  55.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 501 aa  55.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 406 aa  55.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 421 aa  55.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 599 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  31.44 
 
 		 404 aa  54.7  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 464 aa  54.7  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  27.11 
 
 		 397 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 371 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  29.66 
 
 		 380 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 404 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.77 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  23.89 
 
 		 372 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 442 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  23.89 
 
 		 365 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 477 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 742 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 770 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 546 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 372 aa  52  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  23.48 
 
 		 372 aa  52  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  29.66 
 
 		 489 aa  52  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  23.48 
 
 		 372 aa  51.6  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  28.44 
 
 		 439 aa  51.2  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2277  ATP-binding region, ATPase-like  29.2 
 
 		 403 aa  51.2  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  30.73 
 
 		 377 aa  51.2  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 661 aa  51.2  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 414 aa  51.2  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  23.48 
 
 		 372 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  33.68 
 
 		 282 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 421 aa  50.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 372 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  23.48 
 
 		 365 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  33.1 
 
 		 671 aa  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 564 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 344 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 438 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 526 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 372 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  40 
 
 		 462 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 480 aa  49.7  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0077  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 588 aa  49.3  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 682 aa  48.9  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 394 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 458 aa  48.9  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  38.89 
 
 		 598 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  32.71 
 
 		 594 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 598 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 351 aa  48.5  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  30.84 
 
 		 429 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 456 aa  48.9  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  23.48 
 
 		 372 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 469 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>