More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0280 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 382 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 371 aa  225  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 501 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  40.27 
 
 		 404 aa  199  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0353  putative signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  38.7 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 458 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  31.88 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.06 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.68 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  31.92 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  32.98 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.77 
 
 		 643 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 851 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.02 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  31.91 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 894 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  23.18 
 
 		 693 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  32.02 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  24.18 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  33.48 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.63 
 
 		 1033 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0973  putative signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0709163  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  41.49 
 
 		 434 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  23.86 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  21.66 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2763  putative nitrate/nitrite sensor protein  28.12 
 
 		 644 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2629  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.12 
 
 		 644 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2685  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.12 
 
 		 644 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  31.25 
 
 		 490 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  28.57 
 
 		 489 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  29.26 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1850  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  28.57 
 
 		 644 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1870  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  27.2 
 
 		 636 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 692 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  31.19 
 
 		 1009 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  25.47 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 546 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  23.86 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  24.52 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  29.49 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5065  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.48 
 
 		 675 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  29.96 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  29.6 
 
 		 575 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4599  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.63 
 
 		 637 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 575 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 575 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 517 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  27.39 
 
 		 1048 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 638 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  27.23 
 
 		 646 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 481 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  22.3 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  32.39 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  22.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  22.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  22.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3354  histidine kinase  32.88 
 
 		 555 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  22.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  22.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  29.8 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  22.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  27.6 
 
 		 668 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>