102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0278 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 413 aa  786    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  52.69 
 
 		 480 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 		 477 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  42.02 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  41.46 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.83 
 
 		 427 aa  206  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 481 aa  205  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 400 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 480 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 		 484 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.22 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 466 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  40.98 
 
 		 421 aa  192  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  41.73 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.78 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  49.17 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 258 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.95 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  39.76 
 
 		 110 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  39.76 
 
 		 110 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 780 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 851 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  28.86 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  28.86 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  39 
 
 		 108 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.86 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.86 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.86 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.86 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.86 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 110 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  28.86 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  31.5 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  43.1 
 
 		 178 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.86 
 
 		 566 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 564 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  32.26 
 
 		 1033 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2964  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.67 
 
 		 564 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.551015 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 739 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0353  putative signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661618  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  49.06 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  24.76 
 
 		 772 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  30.66 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  35.16 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 485 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 605 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 894 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1510  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.98 
 
 		 573 aa  47  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 381 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  30.91 
 
 		 325 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  27.72 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 770 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 		 603 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 782 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 585 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 548 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2369  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  22.81 
 
 		 563 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  29.58 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  34.68 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.96 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.96 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.82 
 
 		 638 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 184 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 97 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  30.43 
 
 		 847 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  35.71 
 
 		 127 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 638 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.71 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0139  histidine kinase  40.43 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  27.86 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2673  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.87 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.87 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.87 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.87 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.87 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>