46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6043 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 333 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  42.94 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  46.1 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 480 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 444 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 477 aa  185  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.77 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 481 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 400 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  40.67 
 
 		 441 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  39.08 
 
 		 421 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 423 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 433 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.74 
 
 		 417 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 455 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 484 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  56.52 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  50.94 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 739 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 894 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 851 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  46.77 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  49.06 
 
 		 767 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  50 
 
 		 731 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 564 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  24.7 
 
 		 413 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>