More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6526 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 444 aa  870    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  61.32 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  53.37 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  47.89 
 
 		 421 aa  300  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 404 aa  285  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  41.13 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 		 394 aa  272  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  44.12 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.12 
 
 		 404 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  44.47 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  44.56 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 400 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  49.64 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.85 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 449 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  51.67 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.24 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 333 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  37.01 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 564 aa  76.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 523 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  30.47 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  30.47 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.47 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.47 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.47 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.47 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.47 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  30.47 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  28.22 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  29.69 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.21 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.21 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.21 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2673  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.21 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.21 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  27.75 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.61 
 
 		 598 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.99 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  31.47 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.58 
 
 		 1033 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  29.76 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3152  putative signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  0.708256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 682 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  27.27 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.06 
 
 		 731 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.91 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  27.35 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.62 
 
 		 572 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.85 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  27.85 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.16 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.85 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 851 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.85 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.85 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  39.47 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2407  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.57 
 
 		 572 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  27.85 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.85 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  29.11 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  25.47 
 
 		 772 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 725 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  27.96 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4599  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.2 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  28.57 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>