More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0648 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 404 aa  803    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  69.41 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  57.96 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  53.27 
 
 		 400 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  52.7 
 
 		 394 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 458 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  38.69 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 423 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 466 aa  243  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  40.65 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  40.45 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.59 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 477 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 480 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 449 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  51.98 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.72 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 801 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 767 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  32.29 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.19 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  32.38 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 501 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  32.23 
 
 		 1033 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  34.19 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 1168 aa  67.4  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 258 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 508 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  30.26 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 780 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  29.86 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  27.63 
 
 		 640 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 591 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  30.4 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  33.51 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  26.89 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 584 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  28.64 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  26.6 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 851 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 782 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.84 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 652 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  24.76 
 
 		 772 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 775 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  30.39 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  29.08 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  31.22 
 
 		 666 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1567  histidine kinase  30.14 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.19 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  26.61 
 
 		 2361 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 742 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 770 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>