More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3825 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  91.65 
 
 		 423 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 441 aa  867    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  51.87 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 481 aa  279  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.28 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  41.61 
 
 		 440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  41.71 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  39.31 
 
 		 421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 480 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 		 413 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 		 477 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  46.54 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 449 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  54.86 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.86 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  54.65 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.75 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  32.81 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 782 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 739 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 1168 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  30.73 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  33.16 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 1101 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 		 894 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  51.32 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 584 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  24.53 
 
 		 693 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  31.92 
 
 		 1033 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 1226 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  34.03 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  41.38 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 1229 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  26.79 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 767 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  41.76 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  27.93 
 
 		 1031 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  30.99 
 
 		 799 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  28.15 
 
 		 967 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  32.32 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 780 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  28.43 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.98 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 851 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 801 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2277  ATP-binding region, ATPase-like  34.69 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  28.1 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  29.9 
 
 		 384 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 463 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  40.4 
 
 		 573 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 573 aa  56.6  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  35.05 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.31 
 
 		 1048 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  25.25 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>