239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0325 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 440 aa  864    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  29.22 
 
 		 2361 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0077  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  36.04 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  43.82 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  21.55 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  24.16 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 739 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  29.68 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 		 339 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  29.64 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  36.84 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  27.48 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 1168 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 894 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 567 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5902  histidine kinase  29.2 
 
 		 286 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 501 aa  53.9  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  41.57 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 513 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  25.55 
 
 		 405 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  34.48 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2277  ATP-binding region, ATPase-like  40.43 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 658 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 526 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 544 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  34.41 
 
 		 1101 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  22.98 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  35 
 
 		 710 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 614 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  35 
 
 		 710 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0704  histidine kinase  34.95 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 599 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 1229 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  30.8 
 
 		 543 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  27.27 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3762  histidine kinase  32.59 
 
 		 339 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.026612 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.41 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 556 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  29.2 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 682 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 477 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 564 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.41 
 
 		 1226 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  26.33 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  28.22 
 
 		 282 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  33.33 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.25 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 682 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 661 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  26.21 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.72 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3277  histidine kinase  34.21 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389696  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 801 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  37.11 
 
 		 464 aa  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 508 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  36.78 
 
 		 459 aa  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 368 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.99 
 
 		 731 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 357 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 775 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  35.29 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  30.15 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  34.02 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0181  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  33.33 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  29.33 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 603 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.34 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  25.99 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 692 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  27.49 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  33.64 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>