More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1387 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 367 aa  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 1226 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  35 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 513 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 700 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  33.99 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4390  putative signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 795 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 1229 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 1101 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  31.56 
 
 		 830 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 780 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.48 
 
 		 799 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  28.12 
 
 		 482 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  33.06 
 
 		 772 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 546 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 770 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 780 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 451 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.82 
 
 		 797 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  27.73 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  27.73 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 682 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 695 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 490 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 771 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 725 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  29.58 
 
 		 515 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 775 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  32.56 
 
 		 439 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  32.89 
 
 		 518 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 471 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 483 aa  89.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  26.51 
 
 		 388 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  28.84 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 521 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 599 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.28 
 
 		 489 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.18 
 
 		 646 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.18 
 
 		 575 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 575 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 564 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 575 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 799 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 812 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113199  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  27.18 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.47 
 
 		 683 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 489 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  29.2 
 
 		 278 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  26.75 
 
 		 287 aa  86.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  29.07 
 
 		 783 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  32.55 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  35.55 
 
 		 309 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  31.22 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 471 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  28.5 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  31.62 
 
 		 594 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 603 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  28.78 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.96 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  28.78 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  30.09 
 
 		 687 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 801 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  31.09 
 
 		 598 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  28.57 
 
 		 500 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 795 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  30.89 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 795 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  32.56 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  33.18 
 
 		 459 aa  82.8  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  25.96 
 
 		 585 aa  82.8  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  31.46 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  28.51 
 
 		 680 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  29.87 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 692 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.33 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 594 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  29.11 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0930  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.2 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000296832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 691 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>