More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4390 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4390  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 795 aa  1618    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.58 
 
 		 812 aa  1068    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4054  putative signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 1123 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 348 aa  110  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 456 aa  107  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 526 aa  107  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 490 aa  104  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 673 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 541 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 541 aa  101  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 367 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 546 aa  98.2  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 399 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  32.16 
 
 		 368 aa  96.3  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 553 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 370 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 661 aa  95.1  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 464 aa  94.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 484 aa  94.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  30.28 
 
 		 474 aa  94.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  28.78 
 
 		 632 aa  94.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 779 aa  94.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 373 aa  94  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 373 aa  93.6  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  29.82 
 
 		 799 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 801 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 493 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0800  histidine kinase  31.68 
 
 		 389 aa  93.2  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.67 
 
 		 797 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 546 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 662 aa  91.3  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 658 aa  90.9  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  30.87 
 
 		 662 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 485 aa  90.9  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  27.31 
 
 		 515 aa  90.5  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  29.82 
 
 		 485 aa  90.5  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  29.48 
 
 		 489 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  26.16 
 
 		 373 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 795 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 352 aa  90.1  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 1168 aa  89  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 594 aa  89  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 366 aa  88.6  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  29.5 
 
 		 462 aa  88.6  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  30.88 
 
 		 461 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  30.09 
 
 		 687 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  25.52 
 
 		 1046 aa  88.6  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 799 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 477 aa  87.8  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 509 aa  87.8  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 363 aa  87.4  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 682 aa  87.8  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 403 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30.66 
 
 		 640 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  24.06 
 
 		 1739 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 386 aa  87  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 564 aa  87  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 591 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  32 
 
 		 469 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  34.23 
 
 		 338 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.53 
 
 		 325 aa  86.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  26.27 
 
 		 1093 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  28.1 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  29.33 
 
 		 497 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 638 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0099  histidine kinase  30.73 
 
 		 785 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 709 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1567  histidine kinase  32.86 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  29.09 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  30.92 
 
 		 664 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  34.2 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  30.34 
 
 		 783 aa  85.1  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  29.21 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  32.74 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  27.98 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  30.07 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  31.22 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  25.93 
 
 		 670 aa  84.7  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  25.98 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  25.98 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 596 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 591 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  26.17 
 
 		 575 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 665 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 364 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  26.91 
 
 		 598 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3436  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 606 aa  84  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  29.88 
 
 		 373 aa  84  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  27.01 
 
 		 795 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 385 aa  84  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  26.17 
 
 		 575 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.46 
 
 		 646 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  26.64 
 
 		 740 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  28.05 
 
 		 287 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  26.17 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>