More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1652 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  100 
 
 		 373 aa  723    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 471 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 459 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 459 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  40.43 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  38.24 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  38.6 
 
 		 466 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  38.24 
 
 		 466 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  38.24 
 
 		 466 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  40 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  35.08 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  32.88 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 658 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  39.74 
 
 		 662 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  38.24 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  38.24 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  38.24 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 475 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  37.05 
 
 		 470 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  33.46 
 
 		 483 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 481 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  36.25 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  36.94 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  37.39 
 
 		 830 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 691 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  35.21 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 640 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  33.91 
 
 		 482 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  40 
 
 		 640 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  34.12 
 
 		 585 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  34.55 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 644 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 748 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  43 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 799 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  41.55 
 
 		 470 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  40.81 
 
 		 458 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  40.08 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  36.07 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  35.53 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 770 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  32.24 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  35.36 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  35.24 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 700 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 599 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  37.27 
 
 		 2361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 779 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  32.55 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  33.6 
 
 		 518 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  38.86 
 
 		 575 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  36.77 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 575 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  37.29 
 
 		 361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  41.98 
 
 		 485 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  30 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  34.06 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  37.21 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 575 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 688 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 795 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 541 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 603 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  42.66 
 
 		 650 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  36.24 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  35.16 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  38.07 
 
 		 772 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>