More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A2363 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  100 
 
 
466 aa  934    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  100 
 
 
466 aa  934    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  99.79 
 
 
466 aa  932    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.87 
 
 
459 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  99.57 
 
 
466 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.15 
 
 
471 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  78.74 
 
 
461 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  94.85 
 
 
470 aa  885    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  70.11 
 
 
469 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  78.6 
 
 
460 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  78.6 
 
 
480 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.52 
 
 
486 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  100 
 
 
466 aa  934    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.75 
 
 
471 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  79.87 
 
 
459 aa  745    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.09 
 
 
459 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  78.6 
 
 
480 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  99.57 
 
 
466 aa  929    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  99.36 
 
 
466 aa  927    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  53.41 
 
 
456 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  53.1 
 
 
481 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.85 
 
 
475 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  52.8 
 
 
488 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.14 
 
 
488 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.2 
 
 
478 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  51.18 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  49.34 
 
 
456 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 
477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  48.79 
 
 
501 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  45.5 
 
 
470 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 
449 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  45.26 
 
 
458 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  46.19 
 
 
467 aa  358  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  41.58 
 
 
461 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
461 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  42.21 
 
 
459 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
485 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  38.8 
 
 
451 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
447 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
474 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
464 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  35.09 
 
 
483 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  35.85 
 
 
467 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
480 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  38.8 
 
 
456 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  39.4 
 
 
451 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  32.97 
 
 
469 aa  266  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  39.5 
 
 
287 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  34.63 
 
 
564 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 
564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  39.27 
 
 
387 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
695 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  39.73 
 
 
447 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  36.94 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  35.98 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  35.27 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
1229 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  35.78 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
770 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  38.24 
 
 
373 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  30.43 
 
 
553 aa  127  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  30.36 
 
 
553 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
1226 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  35.93 
 
 
1101 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
469 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  27.94 
 
 
553 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  32.75 
 
 
585 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  36.25 
 
 
557 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  40.38 
 
 
489 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
463 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  38.16 
 
 
772 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
594 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
771 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  37.18 
 
 
783 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  38.2 
 
 
249 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
640 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  37.09 
 
 
381 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
410 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
595 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  40.43 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  40.28 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  30.38 
 
 
391 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
359 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.28 
 
 
584 aa  120  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  35.9 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  28.37 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.33 
 
 
683 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  35.9 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
775 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
598 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
700 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
357 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>