More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3746 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 688 aa  1330    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.74 
 
 		 691 aa  990    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 		 700 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 770 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 771 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  41.63 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  45.69 
 
 		 772 aa  177  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 376 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  42.31 
 
 		 783 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  41.85 
 
 		 497 aa  173  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 775 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 376 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  44.26 
 
 		 489 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3782  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 378 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 490 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 490 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1667  ATPase domain-containing protein  36.86 
 
 		 384 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1984  histidine kinase  36.86 
 
 		 373 aa  147  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 366 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 658 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 662 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  31.83 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  31.5 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 		 492 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 		 463 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  41.26 
 
 		 662 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3763  Histidine kinase  41.56 
 
 		 394 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.597205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  38.33 
 
 		 1226 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.77 
 
 		 640 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  35.81 
 
 		 379 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 1229 aa  135  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  37.66 
 
 		 1101 aa  134  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 596 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 595 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  33.18 
 
 		 388 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  30.11 
 
 		 344 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  30.11 
 
 		 344 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  37.77 
 
 		 830 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.17 
 
 		 391 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 312 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  36.09 
 
 		 377 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 553 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  38.84 
 
 		 466 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  38.84 
 
 		 466 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  37.86 
 
 		 404 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 339 aa  127  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  35.78 
 
 		 381 aa  127  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  38.84 
 
 		 466 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  38.84 
 
 		 466 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 363 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  31.76 
 
 		 393 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  38.84 
 
 		 466 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  32.52 
 
 		 685 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  38.43 
 
 		 466 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.41 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4713  histidine kinase  38.49 
 
 		 404 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.739692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  34.11 
 
 		 391 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  33.56 
 
 		 741 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 603 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  38.43 
 
 		 466 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 493 aa  124  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 748 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 448 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 738 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 509 aa  123  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  38.99 
 
 		 373 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 598 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 346 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  39.81 
 
 		 598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  35.81 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  33.11 
 
 		 797 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  34.14 
 
 		 683 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  36 
 
 		 582 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 582 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 		 619 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 695 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  34.11 
 
 		 680 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 703 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  38.08 
 
 		 470 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 673 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  33.85 
 
 		 680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 644 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 459 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 1168 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 450 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 703 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 684 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>