More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4605 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  100 
 
 
403 aa  779    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  44.48 
 
 
413 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  40.36 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
434 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  44.78 
 
 
401 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  37.87 
 
 
402 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  38.5 
 
 
433 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  37.96 
 
 
407 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  38.17 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  41.25 
 
 
422 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
411 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04040  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.631107  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  34.59 
 
 
431 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
458 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
442 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  37.85 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  40.53 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
412 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  34.57 
 
 
413 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  38.91 
 
 
389 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
451 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  40.67 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  35.8 
 
 
575 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  35.39 
 
 
575 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  36.71 
 
 
740 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  35.39 
 
 
575 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0512  histidine kinase  36.56 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  40.08 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
468 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
775 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  40.83 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.9 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  37.07 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
471 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
386 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  33.85 
 
 
432 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
381 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
581 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  41.71 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  36.71 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  37.96 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  31.51 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  33.86 
 
 
1031 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
700 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
352 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
596 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
421 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  37.96 
 
 
466 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
682 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
682 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
595 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
490 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
471 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
469 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
466 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  37.5 
 
 
466 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  37.5 
 
 
466 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
466 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
466 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
466 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
662 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
459 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
594 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
665 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
459 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  35.44 
 
 
662 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  37.44 
 
 
460 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  30.71 
 
 
461 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  29.67 
 
 
339 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
658 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
480 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
391 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
480 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
501 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
401 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
742 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
425 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  33.76 
 
 
447 aa  103  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
381 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 
1648 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.85 
 
 
351 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  37.95 
 
 
384 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
640 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
446 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.85 
 
 
351 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
447 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
456 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  30.37 
 
 
456 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  30.86 
 
 
497 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  27.85 
 
 
351 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.95 
 
 
515 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
459 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  32.52 
 
 
783 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  28.75 
 
 
351 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>