More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_21830 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  100 
 
 
391 aa  780    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  44.53 
 
 
392 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  44.04 
 
 
388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  42.52 
 
 
391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  44.74 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  44.59 
 
 
393 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  47.64 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  41.73 
 
 
384 aa  303  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  43.62 
 
 
396 aa  299  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  42.05 
 
 
381 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  42.43 
 
 
393 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  33.06 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  37.36 
 
 
353 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  35.92 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  33.61 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  33.24 
 
 
358 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  40.09 
 
 
366 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  35.91 
 
 
482 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
779 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  36.28 
 
 
338 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  38.28 
 
 
337 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
658 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
662 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  39.27 
 
 
662 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  31.83 
 
 
349 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
591 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
469 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
521 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
574 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  37.19 
 
 
529 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
748 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  33.64 
 
 
497 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
591 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  37.26 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  32.68 
 
 
223 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  32.91 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  36.05 
 
 
640 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
584 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  30.77 
 
 
363 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  34.48 
 
 
462 aa  136  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
546 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  35.5 
 
 
394 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
548 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
695 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
381 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  32.94 
 
 
467 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  35.65 
 
 
381 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
401 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
401 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  35.65 
 
 
381 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
1229 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
448 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
700 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  35.1 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  34.85 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  36.49 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
725 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
599 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.47 
 
 
1101 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.88 
 
 
373 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4182  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
389 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
1226 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  30.87 
 
 
485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  34.13 
 
 
357 aa  127  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
486 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
399 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  36.67 
 
 
451 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
403 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.48 
 
 
489 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
594 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
450 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
469 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
339 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
508 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  32.9 
 
 
470 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
595 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1984  histidine kinase  31.9 
 
 
373 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  33.02 
 
 
458 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
471 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
477 aa  123  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1667  ATPase domain-containing protein  31.9 
 
 
384 aa  123  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
459 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
596 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
449 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.63 
 
 
456 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
775 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
650 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
541 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
771 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
598 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  35.38 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  31.03 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  30.92 
 
 
596 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>