More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6820 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  100 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1557  putative signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0011  histidine kinase  36.84 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  31.44 
 
 		 653 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 443 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0719701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  31.74 
 
 		 1739 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 490 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 658 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 662 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  30.8 
 
 		 662 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 1168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  28.1 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  29.07 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 489 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  31.03 
 
 		 482 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  32.92 
 
 		 518 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  28.94 
 
 		 664 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  31.11 
 
 		 710 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  31.11 
 
 		 710 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 541 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 526 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 339 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  29.57 
 
 		 1046 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 421 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  30.31 
 
 		 643 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 700 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  29.91 
 
 		 373 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.62 
 
 		 466 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  31.55 
 
 		 830 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  31.73 
 
 		 525 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  29.66 
 
 		 489 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 748 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 603 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  29.86 
 
 		 738 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 451 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 575 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  28.51 
 
 		 575 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  29.58 
 
 		 381 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 535 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1869  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 553 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  28.11 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 348 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.96 
 
 		 383 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  28.92 
 
 		 515 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  27.7 
 
 		 640 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.06 
 
 		 683 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 480 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 574 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  33.03 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 541 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  29.36 
 
 		 740 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 695 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  26.69 
 
 		 387 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  29.74 
 
 		 527 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  29.63 
 
 		 497 aa  99  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 462 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 462 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 467 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 682 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.78 
 
 		 797 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 478 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 546 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 692 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 585 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  25.76 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 403 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 1101 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  32.14 
 
 		 364 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 474 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 485 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 401 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 485 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  30.69 
 
 		 373 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 384 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  26.63 
 
 		 430 aa  95.9  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  29.36 
 
 		 391 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  28.4 
 
 		 373 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 799 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 553 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  31.74 
 
 		 632 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 1226 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 399 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 1229 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  25.57 
 
 		 1063 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  27.12 
 
 		 397 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  28.79 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 700 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  27.8 
 
 		 670 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  29.43 
 
 		 645 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 385 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  26.26 
 
 		 422 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.56 
 
 		 388 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  28.92 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  29.66 
 
 		 799 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>