153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4281 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 408 aa  792    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 894 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3152  putative signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  0.708256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 775 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 745 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  32.54 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  43.96 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 767 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 851 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.04 
 
 		 731 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 673 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  35.65 
 
 		 640 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  31.34 
 
 		 282 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 658 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 1226 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 739 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 1101 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  33.04 
 
 		 662 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  38.82 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 661 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  25.86 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  38.68 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 682 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  41.94 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 700 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 662 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 501 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 1229 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 725 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  38.79 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0704  histidine kinase  29.09 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  26.98 
 
 		 556 aa  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 346 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  29 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  29 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  40.48 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  26.26 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  30 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 535 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  29 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  29 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  29 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  29 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  31.45 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4345  putative signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.262209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  25.5 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  25.5 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 640 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 352 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  38.78 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  30.99 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 571 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 591 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.33 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 553 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  32.23 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  35.48 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 466 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 501 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 780 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 523 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 481 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  25 
 
 		 462 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 351 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 523 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  42.5 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  29.75 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  29.61 
 
 		 523 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 523 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  32.65 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>