More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5875 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 851 aa  1618    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 894 aa  306  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 780 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 368 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  47.87 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 782 aa  74.7  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 458 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.34 
 
 		 382 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  33.49 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 481 aa  67.4  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  35.61 
 
 		 440 aa  67.4  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 682 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  31.4 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 394 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  33.33 
 
 		 1033 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  32 
 
 		 397 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 394 aa  63.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  41 
 
 		 666 aa  62.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3277  histidine kinase  41.35 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389696  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3115  histidine kinase  32.71 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 258 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 408 aa  62  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  26.69 
 
 		 643 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  32.02 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 438 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  32.02 
 
 		 394 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 381 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 381 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  41.67 
 
 		 309 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 745 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  32.81 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  30.03 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  43.62 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3762  histidine kinase  39.42 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.026612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  28.85 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  39.05 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  23.38 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  24.07 
 
 		 339 aa  56.6  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 682 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  31.03 
 
 		 387 aa  57  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 421 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 564 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 404 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.5 
 
 		 417 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 400 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.68 
 
 		 323 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 487 aa  56.2  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 391 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 480 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  25.46 
 
 		 606 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 408 aa  56.2  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  29.97 
 
 		 431 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  29.8 
 
 		 783 aa  56.2  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  36.63 
 
 		 646 aa  55.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 480 aa  55.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  23.11 
 
 		 645 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 801 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3763  Histidine kinase  36.61 
 
 		 394 aa  55.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.597205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  28.74 
 
 		 402 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 638 aa  55.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  43.48 
 
 		 407 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 459 aa  55.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  44.44 
 
 		 401 aa  54.7  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 615 aa  54.7  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  26.82 
 
 		 653 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  35.48 
 
 		 501 aa  54.7  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3152  putative signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 		 396 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  0.708256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 394 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 441 aa  54.3  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4599  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.13 
 
 		 637 aa  54.7  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  29.29 
 
 		 427 aa  53.9  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  38.78 
 
 		 373 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 599 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  43.01 
 
 		 687 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 770 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 445 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.54 
 
 		 731 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 610 aa  54.3  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 423 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  22.75 
 
 		 370 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 700 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>