More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2254 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  78.47 
 
 		 421 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 408 aa  840    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 780 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 780 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  36.44 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 513 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  36.17 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  32.89 
 
 		 740 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 1168 aa  126  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 662 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.7 
 
 		 662 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 575 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  33.11 
 
 		 575 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 658 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 575 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  32.74 
 
 		 1739 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  34.36 
 
 		 598 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 598 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  27.45 
 
 		 830 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 799 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 775 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 770 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 594 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.9 
 
 		 515 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  29.89 
 
 		 783 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 595 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 640 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  33.74 
 
 		 525 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  30.25 
 
 		 772 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  33.58 
 
 		 582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 748 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.08 
 
 		 640 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  29.31 
 
 		 619 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  33.66 
 
 		 670 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  29.31 
 
 		 680 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  33.95 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  29.31 
 
 		 680 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  33.63 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  28.91 
 
 		 687 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 461 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  31.53 
 
 		 343 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  33.77 
 
 		 1809 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 795 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 		 795 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 		 795 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.84 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  32.51 
 
 		 645 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.31 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 459 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 1046 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  36.36 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 366 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  35.05 
 
 		 1226 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  24.94 
 
 		 795 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 700 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  24.76 
 
 		 799 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  32.74 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 784 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  35.2 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  34.11 
 
 		 1101 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  30.93 
 
 		 638 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 1229 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 552 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 606 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  29 
 
 		 458 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 490 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  26.1 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 703 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 771 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 700 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>