60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2535 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 666 aa  1287    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  32.04 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 851 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.47 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 782 aa  60.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 894 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 739 aa  54.7  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 458 aa  55.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  26.48 
 
 		 427 aa  54.7  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 466 aa  54.3  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 352 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 394 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 556 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 386 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 414 aa  51.2  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  36.52 
 
 		 640 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1105  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 632 aa  50.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.097468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  35.29 
 
 		 373 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 421 aa  50.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 398 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  28.64 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  29.23 
 
 		 394 aa  48.9  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 480 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 682 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 449 aa  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 517 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 745 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.99 
 
 		 373 aa  47.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  25.86 
 
 		 441 aa  47.4  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 394 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  25.66 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 351 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  39.8 
 
 		 662 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 662 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 370 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 396 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 484 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 658 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.62 
 
 		 772 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3763  Histidine kinase  33.05 
 
 		 394 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 351 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.214404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 347 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3010  histidine kinase  28.99 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.335446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  21.98 
 
 		 351 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 564 aa  45.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  36.22 
 
 		 377 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.31 
 
 		 372 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 477 aa  44.3  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2189  histidine kinase  36.63 
 
 		 608 aa  44.3  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  28.43 
 
 		 440 aa  43.9  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 480 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 574 aa  43.9  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>