294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4834 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 782 aa  1476    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 739 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 894 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 851 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  32.67 
 
 		 397 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  32.92 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 725 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  29.77 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  35.68 
 
 		 434 aa  73.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 780 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 767 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  31.58 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 391 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.1 
 
 		 731 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  29.7 
 
 		 364 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  32.93 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.68 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  31.38 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_92  sensor histidine kinase  33.07 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  33.33 
 
 		 282 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3152  putative signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  0.708256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  44.76 
 
 		 662 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 419 aa  62  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  28.4 
 
 		 543 aa  62  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  27.04 
 
 		 427 aa  62  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3115  histidine kinase  32.47 
 
 		 483 aa  62  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.34 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 372 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 372 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 372 aa  60.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 365 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  24.86 
 
 		 372 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 396 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 658 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 480 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 745 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0294  histidine kinase  32.28 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  23.17 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  27.52 
 
 		 967 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  40.91 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  28.23 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 351 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 351 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 801 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 400 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 351 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 556 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 398 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 444 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 365 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  27.57 
 
 		 351 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 351 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 351 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 351 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  34.19 
 
 		 620 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  33 
 
 		 1033 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0973  putative signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 592 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0709163  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 570 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 351 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 483 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  37.96 
 
 		 481 aa  55.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 401 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  31.09 
 
 		 413 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 370 aa  55.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  24.49 
 
 		 582 aa  55.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 582 aa  55.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 1168 aa  54.7  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 682 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 		 352 aa  54.7  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.51 
 
 		 1226 aa  54.7  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 624 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 414 aa  54.3  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>