More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0729 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
398 aa  786    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
398 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10862  two component sensor kinase  32.92 
 
 
425 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.889894  hitchhiker  0.000152401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0486  putative signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
408 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  35.78 
 
 
469 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  31.37 
 
 
1739 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  30.21 
 
 
489 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  30.8 
 
 
467 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  29.47 
 
 
772 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
466 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
478 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  29.86 
 
 
1046 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
564 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  30.83 
 
 
451 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
665 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
780 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  29.97 
 
 
313 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
364 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
658 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3115  histidine kinase  32 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
725 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.89 
 
 
598 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
485 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
780 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  32.02 
 
 
466 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
594 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
470 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
598 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  32.02 
 
 
466 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
466 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
662 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  32.02 
 
 
466 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
640 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
466 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
466 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
466 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
463 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  35.27 
 
 
298 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.66 
 
 
405 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
352 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  35.15 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
490 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
469 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.84 
 
 
456 aa  90.1  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.78 
 
 
683 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  30.84 
 
 
518 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2894  sensor histidine kinase  24.3 
 
 
529 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0785038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
1168 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
513 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
682 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  33.59 
 
 
456 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
475 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.33 
 
 
662 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.52 
 
 
640 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  32.99 
 
 
223 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  26.73 
 
 
693 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  32.39 
 
 
483 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  31.07 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
574 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
595 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  30.93 
 
 
278 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
584 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  28.51 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  29.08 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
596 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2958  two-component sensor histidine kinase  24.06 
 
 
529 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.38 
 
 
456 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
480 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  32.39 
 
 
296 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  30.59 
 
 
357 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  28.7 
 
 
1226 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.15 
 
 
482 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
471 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  34.72 
 
 
481 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  29.78 
 
 
384 aa  86.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
1229 aa  86.3  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
682 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  28.22 
 
 
357 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
700 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  29.84 
 
 
596 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  31.67 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
591 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.9 
 
 
1063 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  33.97 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  29.19 
 
 
664 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  33.33 
 
 
1031 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
395 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>