157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4905 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 731 aa  1446    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 		 767 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 745 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 368 aa  97.4  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 894 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  27.24 
 
 		 646 aa  60.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  31 
 
 		 387 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 386 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 682 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 258 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  30.45 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.29 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  40.43 
 
 		 394 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 458 aa  57  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 739 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 508 aa  55.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  42.53 
 
 		 441 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 442 aa  55.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  30.4 
 
 		 440 aa  55.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 408 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 419 aa  54.7  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  31.44 
 
 		 421 aa  54.3  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 371 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1880  hypothetical protein  27.8 
 
 		 364 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 344 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 725 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  28.71 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2277  ATP-binding region, ATPase-like  39.78 
 
 		 403 aa  52.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2146  putative signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 467 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00275148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 484 aa  52.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  29.53 
 
 		 364 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 564 aa  52  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  29.44 
 
 		 462 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 352 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  21.24 
 
 		 693 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 412 aa  51.6  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.19 
 
 		 1033 aa  51.6  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  41.11 
 
 		 650 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  35.24 
 
 		 422 aa  50.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 339 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 440 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 418 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 780 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  30.25 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.53 
 
 		 583 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 391 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 782 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 801 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 398 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 841 aa  48.9  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0705515  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 584 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  28.91 
 
 		 671 aa  48.5  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 388 aa  48.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.214404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 363 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 591 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 851 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 374 aa  48.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 481 aa  47.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 421 aa  47.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 400 aa  47.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  36.56 
 
 		 643 aa  47.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  28.15 
 
 		 575 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 591 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  35.38 
 
 		 403 aa  47.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  26.98 
 
 		 772 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 477 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 458 aa  47.8  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  33.88 
 
 		 448 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  28.92 
 
 		 619 aa  47.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 345 aa  47.4  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  34.78 
 
 		 425 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  27.73 
 
 		 575 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 359 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  25.62 
 
 		 293 aa  47.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 421 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 575 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 568 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 398 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  28.19 
 
 		 1024 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 582 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  36.67 
 
 		 582 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  41.56 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.82 
 
 		 323 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  36.13 
 
 		 577 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 438 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  37.35 
 
 		 1809 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 370 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>