150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6903 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 780 aa  1496    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 894 aa  214  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 851 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 368 aa  87.8  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 745 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  49.04 
 
 		 739 aa  80.9  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  36.56 
 
 		 440 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 394 aa  70.1  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.77 
 
 		 731 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  34.81 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  29.13 
 
 		 397 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  35.03 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 364 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.36 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3938  hypothetical protein  32.67 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.789456  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 682 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 723 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 398 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1880  hypothetical protein  39.56 
 
 		 364 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 564 aa  54.3  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  22.62 
 
 		 413 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  34.96 
 
 		 689 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 440 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 408 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 400 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  34.56 
 
 		 466 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 466 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 466 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  34.56 
 
 		 466 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 466 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 258 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 481 aa  52  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  34.56 
 
 		 466 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 682 aa  51.6  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  33.59 
 
 		 395 aa  51.2  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  29.41 
 
 		 394 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  33.58 
 
 		 466 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.4 
 
 		 382 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 461 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 655 aa  50.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  35.25 
 
 		 489 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 381 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 381 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 381 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 546 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  30.77 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  40.57 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0512  histidine kinase  30.65 
 
 		 339 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3152  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 396 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  0.708256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 419 aa  49.7  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.99 
 
 		 646 aa  49.3  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 411 aa  48.9  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 371 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 445 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  30.39 
 
 		 309 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  33.61 
 
 		 686 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 363 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  33.61 
 
 		 456 aa  48.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  35.79 
 
 		 385 aa  47.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 487 aa  48.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  29.6 
 
 		 384 aa  47.8  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 413 aa  48.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 372 aa  48.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  29.15 
 
 		 364 aa  47.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  27.8 
 
 		 490 aa  47.8  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  31.47 
 
 		 666 aa  47.8  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  29.17 
 
 		 572 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 444 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 780 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  27.5 
 
 		 469 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  32.61 
 
 		 458 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 468 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.76 
 
 		 456 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 351 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  20.97 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  20.97 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  30.28 
 
 		 457 aa  46.6  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  20.97 
 
 		 365 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 658 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 780 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 645 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 402 aa  46.6  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 459 aa  46.6  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 485 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  29.89 
 
 		 404 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 351 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1317  sensory box sensor histidine kinase  24.51 
 
 		 353 aa  47  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>