More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0974 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 584 aa  1125    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 566 aa  276  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3510  histidine kinase  45.07 
 
 		 559 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3278  ATPase domain-containing protein  41.53 
 
 		 563 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3119  ATPase domain-containing protein  38.44 
 
 		 535 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  35.42 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  35.44 
 
 		 1031 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 421 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 564 aa  104  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  31.88 
 
 		 552 aa  100  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  34.93 
 
 		 462 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 1648 aa  97.8  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  38.04 
 
 		 653 aa  97.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  36.36 
 
 		 2361 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  36.27 
 
 		 372 aa  97.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 652 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  32.92 
 
 		 1048 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 665 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 381 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 381 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 779 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 381 aa  95.1  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 392 aa  95.5  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 456 aa  94.7  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 662 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  34.65 
 
 		 662 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  31.71 
 
 		 413 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  38.14 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  35.78 
 
 		 717 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 399 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  31.67 
 
 		 395 aa  92.8  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5065  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.78 
 
 		 675 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 658 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  33.5 
 
 		 337 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  32.66 
 
 		 430 aa  92  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 396 aa  91.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  32.82 
 
 		 348 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 351 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 351 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 742 aa  91.3  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  33.33 
 
 		 381 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 351 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 352 aa  90.9  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  31.82 
 
 		 347 aa  90.5  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 347 aa  90.5  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  31.07 
 
 		 351 aa  90.5  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0930  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.83 
 
 		 567 aa  90.5  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000296832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 351 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 725 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 372 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  34.72 
 
 		 687 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  38.07 
 
 		 594 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  33.66 
 
 		 640 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 584 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  31.64 
 
 		 373 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  33.33 
 
 		 397 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4708  histidine kinase  31.33 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  34.76 
 
 		 689 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.48 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  24.8 
 
 		 372 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 469 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 638 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 594 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 403 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 610 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  36.27 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  36.27 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  36.27 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  29.81 
 
 		 572 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 394 aa  88.2  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.6 
 
 		 413 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  36.27 
 
 		 466 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 552 aa  88.2  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  36.27 
 
 		 466 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  33.82 
 
 		 638 aa  87.8  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  36.27 
 
 		 466 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 463 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  30.22 
 
 		 1033 aa  87.4  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 401 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 401 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 401 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  24.54 
 
 		 372 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2407  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  29.82 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 591 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 517 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  35.29 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>